Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ALDH6A1Q02252 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALDH6A1Q02252 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms