Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DEFA6Q01524 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms