Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX3P78415 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRX3P78415 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRX3P78415 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX3P78415 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX3P78415 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX3P78415 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms