Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX6P78412 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX6P78412 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX6P78412 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX6P78412 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX6P78412 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX6P78412 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX6P78412 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms