Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP46P62068 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP46P62068 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP46P62068 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP46P62068 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP46P62068 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms