Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJA9P57773 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJA9P57773 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJA9P57773 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJA9P57773 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GJA9P57773 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GJA9P57773 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms