Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP107P57740 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP107P57740 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP107P57740 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP107P57740 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP107P57740 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms