Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RIPK4P57078 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RIPK4P57078 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms