Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PGDP52209 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGDP52209 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGDP52209 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGDP52209 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGDP52209 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PGDP52209 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PGDP52209 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PGDP52209 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PGDP52209 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms