Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SMARCA4P51532 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SMARCA4P51532 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms