Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUP153P49790 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUP153P49790 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUP153P49790 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUP153P49790 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUP153P49790 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP153P49790 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP153P49790 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP153P49790 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms