Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSEN1P49768 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms