Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX1P48742 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX1P48742 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LHX1P48742 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LHX1P48742 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LHX1P48742 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LHX1P48742 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms