Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CSNK1A1P48729 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms