Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIA4P48058 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms