Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ARL1P40616 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ARL1P40616 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARL1P40616 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL1P40616 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL1P40616 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL1P40616 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL1P40616 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL1P40616 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARL1P40616 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms