Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARL3P36405 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARL3P36405 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARL3P36405 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARL3P36405 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms