Protein–RNA interactions for Protein: P35789

ZNF93, Zinc finger protein 93, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF93P35789 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF93P35789 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms