Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT3P35638 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms