Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCGF2P35227 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms