Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBP1P32455 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBP1P32455 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBP1P32455 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBP1P32455 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GBP1P32455 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBP1P32455 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms