Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFNP31947 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFNP31947 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFNP31947 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFNP31947 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFNP31947 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFNP31947 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms