Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARID4AP29374 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARID4AP29374 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms