Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTPRMP28827 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPRMP28827 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms