Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HLA-DMAP28067 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms