Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTNNA2P26232 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms