Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXA5P20719 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA5P20719 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms