Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGB6P18564 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms