Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GNB3P16520 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB3P16520 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB3P16520 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB3P16520 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB3P16520 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB3P16520 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GNB3P16520 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB3P16520 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB3P16520 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB3P16520 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms