Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CREB1P16220 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CREB1P16220 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CREB1P16220 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CREB1P16220 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CREB1P16220 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CREB1P16220 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CREB1P16220 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms