Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRF1P14222 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRF1P14222 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRF1P14222 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms