Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRG2P13727 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRG2P13727 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRG2P13727 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms