Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KRT10P13645 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRT10P13645 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KRT10P13645 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KRT10P13645 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KRT10P13645 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms