Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A1P11836 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms