Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCRP11274 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCRP11274 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCRP11274 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCRP11274 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCRP11274 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCRP11274 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCRP11274 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCRP11274 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCRP11274 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCRP11274 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCRP11274 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCRP11274 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCRP11274 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms