Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMC1P11047 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LAMC1P11047 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms