Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHGAP10645 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHGAP10645 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHGAP10645 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHGAP10645 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHGAP10645 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHGAP10645 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHGAP10645 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHGAP10645 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHGAP10645 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHGAP10645 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHGAP10645 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHGAP10645 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHGAP10645 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHGAP10645 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHGAP10645 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHGAP10645 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHGAP10645 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHGAP10645 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHGAP10645 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms