Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM225BP0DP42 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms