Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAA2P0DJI9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms