Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOXF2BP0C7M4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms