Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPBP07199 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPBP07199 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPBP07199 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPBP07199 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPBP07199 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPBP07199 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPBP07199 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPBP07199 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPBP07199 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms