Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPLP1P05386 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms