Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APBA3O96018 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APBA3O96018 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APBA3O96018 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APBA3O96018 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APBA3O96018 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APBA3O96018 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APBA3O96018 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APBA3O96018 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APBA3O96018 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APBA3O96018 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms