Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC24BO95487 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms