Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MBD4O95243 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD4O95243 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD4O95243 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MBD4O95243 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MBD4O95243 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MBD4O95243 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MBD4O95243 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MBD4O95243 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms