Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SCAF4O95104 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCAF4O95104 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms