Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLIT2O94813 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLIT2O94813 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms