Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAPN15O75808 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPN15O75808 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms