Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA3O75145 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA3O75145 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms