Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCN2BO60939 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms